La mayoría de los pacientes con apnea del sueño subyacente no padecen síndrome de obesidad-hipoventilación (SHO). Lo contrario no es cierto. La mayoría de los pacientes con SHO tienen apnea del sueño concomitante. Los pacientes con apnea del sueño por sí sola no tienen una Pco2 significativamente elevada en los gases en sangre arterial, a diferencia de a pacientes con SHO que, por definición, tienen Pco2 arterial elevada. El diagnóstico de apnea del sueño se realiza mediante antecedentes y estudios del sueño. La obesidad, la retención de CO2 y la exclusión de otros procesos patológicos que causan hipoventilación conducen al diagnóstico de SHO.